Die E3 war eine Atlantic, die von der PRR parallel zu ihrer E2 gebaut wurde und weitgehend baugleich war, aber größere Zylinder hatte. Zwischen 1901 und 1910 wurden insgesamt acht E3, 114 E3a und 56 E3d in den Juniata-Werken in Altoona gebaut. Mit ihren Kuppelrädern von 80 Zoll (2.032 mm) konnten sie keine hohe Zugkraft aufbringen, doch mit der Einführung von Stahl-Personenwagen wurde dies durch den Einsatz in Doppeltraktion ausgeglichen.

Nachdem die leistungsstärkeren E6-Atlantics eingeführt worden waren, wurden die E2 und E3 als „Light Atlantics” bezeichnet. Ab 1912 wurden sie auf Heißdampf umgebaut und ihr Kesseldruck wurde von 205 auf 195 psi gesenkt. In diesem Prozess wurden insgesamt 90 E2a, E2d, E3a und E3d zur E3sd. Sie waren bis in die dreißiger Jahre im Einsatz und wurden dann alle verschrottet.